Спецслужбы США, в обмен на укрытие, получают от заключенного ценную информацию. На небольшом корабле, направляющемся в эту страну, находится группа террористов. Для того чтобы проверить эту информацию, Фрэнки Элрой-Килмер, специального агента, посылают в Джакарту. Если местный информатор подтвердит эту информацию, она должна будет узнать, кто является главарем группировки. Но ей не дано было выполнить миссию – Френки взяли в плен, ранив ее. За дело принимается Джон Килмер, агент ФБР, а по совместительству бывший муж Френки. У него в руках техника последнего поколения, и с помощью спецгруппы "Матрица: угроза" он должен уничтожить эту террористическую группировку...
Как говорится в одной расхожей фразе: «Вы не верите в нашу демократию? Тогда мы летим к Вам». «Матрица», в данном случае, это специальный отчет предоставляемый Президенту США, каждое утро, в котором содержится информация о самых активных террористических угрозах оплоту мировой демократии.
Специально собранная команда из профессионалов: ЦРУ, ФБР, АНБ, занимается разрешением возникающих проблем, как на территории страны, так и за ее пределами. Как и в большинстве американских сериалов, здесь также есть Герой, этакий борец не за деньги, звания и личную выгоду, а за справедливость и Мир во всем мире! Ведь подобные герои всегда в тени…