Со вторым сезоном возвращается проект Бит Экс. Это прямое продолжение набравшей популярность телевизионной версии. В центре внимания сюжета оказывается борьба против некой империи Кикай, которая долгие годы скрывалась от человеческого взора в глубинах пустыни Гоби. Котако Такияма крайне поздно смог раскрыть существование этой расы, однако теперь, когда перед ним нет преград, главный персонаж не может не продолжить своё исследование. Правда, среди представителей Кикай находятся те, кто готовы заставить персонажа замолчать, однако брат Котаро тоже вступает в дело, чтобы не дать в обиду своего близкого человека.