Когда-то гениальный ученый Сет Брандел в машине телепортации объединил себя с мухой, он погиб, но его сын, с тем же сумасшедшим набором генов появился на свет. Фильм «Муха 2» (The Fly II) о судьбе этого особенного мальчика. Мартин Брандл внешне ничем от людей не отличается, только растет безумно быстро, в 5 лет он уже абсолютно взрослый и начинает работать над проблемой телепортации. При этом ничего не зная о том, кто его отец и как он умер. Мартин верит своим коллегам, которые объясняют его сверхбыстрый рост редкой болезнью, он начинает жить самостоятельно и пытается наладить личную жизнь. Но процесс мутации начинается и его сложно спутать с какой бы то ни было заболеванием. Тем более, Мартин узнает историю Сета Брандла, понимает, что ему врали всю жизнь, а сам он постоянно находился под наблюдением. Есть ли шанс у Мартина Брандла не повторить судьбу отца или все же его судьба быть объектом для исследований? Увидит ли девушка Мартина в ужасном чудовище того парня которого полюбила, захочет ли ему помочь? Сможет ли герой остаться человеком в теле монстра и не превратится в монстра, получив человеческое лицо?