Действия фильма, являющегося заключительной частью культового ужастика «Чужой», разворачиваются спустя 200 лет после гибели Элен Рипли. За это долгое время технологический прогресс шагнул настолько сильно, что ученые, работающие на оборонную промышленность, клонируют лейтенанта Рипли, а вместе с ней и зародыша матки Чужих. Однако это уже немного не та Элен, ведь во время эксперимента произошло смешивание генов человека и чудовища, в результате чего созданный клон стал превосходить обычного человека по многим параметрам, и самое главное теперь кровь Рипли, такая же точно как и у Чужих. Заполучив в свои руки матку, способную воспроизводить жизнеспособное потомство, военные решают использовать это в своих целях. Вот только они одного не учли, что такое совершенного убийцу как Чужой невозможно контролировать, и рано или поздно монстр окажется на свободе, и тогда быть большой беде.