Сюжет развивается с периода, когда в Японском море фиксируются бесследные исчезновения кораблей, оставляющих после себя только оборванные радиограммы, из которых удается прочесть только то, что экипаж видит столпы пламени, вырывающиеся из морских недр. Спустя время в крохотной деревеньке, разместившейся на острове Одо, происходят инциденты, в которых аборигены обвиняют некое мифическое существо, дав ему прозвище Годзилла. С целью исследовать природу непонятных происшествий, о которых молва достигла другой стороны океана, на остров приезжает доктор Кёхэй Яманэ с группой ученых. Они выявляют древнего, уже вымершего морского членистоногого трилобита, а позже натыкаются на самого громаднейшего териодонта, достигающего высоты в пятьдесят метров.Вернувшись в Токио профессор излагает свои мысли относительно пробудившегося монстра, который является древнейшим отпрыском известных рептилий, существовавших многие миллионы лет назад. Ихтиозавр испускает сильнейшую радиацию - должно быть ему удалось воскреснуть в результате испытаний американцами ядерного оружия.